優(yōu)點(diǎn)：作為經(jīng)典的核酸染料，EB 具有出色的染色靈敏度，能與 DNA 和 RNA 緊密結(jié)合，哪怕是極微量的核酸也能被清晰染色，適用于對(duì)靈敏度要求核酸檢測(cè)場(chǎng)景。同時(shí)，EB 與核酸結(jié)合后，在紫外光激發(fā)下可產(chǎn)生強(qiáng)熒光信號(hào)，使核酸條帶在凝膠成像中清晰可見(jiàn)，便于觀(guān)察和分析 。此外，EB 的價(jià)格相對(duì)較低，在大規(guī)模核酸檢測(cè)實(shí)驗(yàn)中，使用成本優(yōu)勢(shì)明顯，適合預(yù)算有限且對(duì)安全性要求不苛刻的實(shí)驗(yàn)室基礎(chǔ)研究 。

缺點(diǎn)：EB 是一種強(qiáng)誘變劑，具有高致癌性，可嵌入 DNA 堿基對(duì)之間，干擾 DNA 復(fù)制和轉(zhuǎn)錄，對(duì)實(shí)驗(yàn)人員的健康構(gòu)成嚴(yán)重威脅，長(zhǎng)期接觸易引發(fā)基因突變和癌癥 。而且，EB 具有高毒性，進(jìn)入環(huán)境后難以降解，會(huì)對(duì)生態(tài)系統(tǒng)造成持久危害，需特殊處理廢棄物 。另外，EB 染色后背景熒光較高，會(huì)影響核酸條帶分辨率，尤其是在檢測(cè)小分子核酸或低濃度核酸時(shí)，易導(dǎo)致條帶模糊、難以準(zhǔn)確分析 。

優(yōu)點(diǎn)：SafeGreen 分子量較大，無(wú)法穿透細(xì)胞膜，低細(xì)胞毒性和低致突變性使其對(duì)實(shí)驗(yàn)人員和環(huán)境更友好，尤其適用于細(xì)胞培養(yǎng)等對(duì)生物安全性要求高的實(shí)驗(yàn) 。在瓊脂糖凝膠電泳中，無(wú)論是低濃度還是高濃度核酸樣品，SafeGreen 都能清晰顯示條帶，靈敏度與傳統(tǒng)高靈敏度染料相當(dāng)，可滿(mǎn)足 PCR 產(chǎn)物鑒定等多種實(shí)驗(yàn)需求 。同時(shí)，SafeGreen 與常用電泳緩沖溶液兼容性良好，對(duì)溫度、pH 值等環(huán)境因素變化有一定耐受性，熒光信號(hào)穩(wěn)定，不易淬滅，能保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性 。此外，采用膠染法染色時(shí)，SafeGreen 不會(huì)影響 DNA 條帶遷移，也無(wú)條帶扭曲現(xiàn)象，還可被藍(lán)光和紫外光激發(fā)，適配不同成像設(shè)備，應(yīng)用靈活 。

缺點(diǎn)：由于在研發(fā)和生產(chǎn)過(guò)程中對(duì)安全性和性能要求高，SafeGreen 的成本和市場(chǎng)價(jià)格相對(duì)較高，對(duì)于樣本量大、預(yù)算有限的實(shí)驗(yàn)室，使用成本是較大負(fù)擔(dān) 。在某些檢測(cè)條件下，與部分超敏型核酸染料相比，SafeGreen 的熒光強(qiáng)度可能不足，對(duì)于含量極低且缺乏信號(hào)放大手段的核酸樣本檢測(cè)，可能無(wú)法提供足夠強(qiáng)的熒光信號(hào) 。采用泡染法時(shí)，SafeGreen 染色時(shí)間相對(duì)較長(zhǎng)，通常需振蕩孵育 30 - 60 分鐘，不適用于追求快速出結(jié)果的實(shí)驗(yàn)場(chǎng)景 。